Metagenómica
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Qué es

Curso introductorio para iniciar proyectos de metagenómica con criterio técnico. Cubre fundamentos del campo, comparación entre enfoques (amplicones vs shotgun) y elementos críticos de diseño experimental y muestreo.

Qué incluye

• Fundamentos: historia, conceptos clave y aplicaciones actuales.
• Criterios para elegir amplicones (16S/ITS) vs metagenómica shotgun.
• Diseño experimental: hipótesis, réplicas, profundidad de secuenciación y controles.
• Preparación de muestras: preservación, almacenamiento y extracción de ADN por matriz.
• Calidad/cantidad de ácidos nucleicos y fuentes comunes de sesgo/contaminación.

Alcance

• Nivel introductorio, sin requerir experiencia previa en bioinformática.
• Enfoque teórico-práctico con discusión de casos y artículos.
• Modalidad virtual sincrónica en vivo.

Contenido (cronograma)

• Sesión 1: Historia, conceptos clave y amplicones vs shotgun.
• Sesión 2: Diseño experimental, réplicas, profundidad y controles (negativos/positivos/mock).
• Sesión 3: Estrategias de muestreo, preservación y métodos de lisis.
• Sesión 4: Extracción, cuantificación (Nanodrop/Qubit/TapeStation), control de calidad y contaminación.

Requisitos

• Conocimientos básicos de biología molecular (ADN, PCR, secuenciación).
• Familiaridad con conceptos generales de microbiología.
• No se requiere experiencia previa en bioinformática.

Entregables

• Plantillas de diseño experimental y checklists de control de calidad.
• Recursos de apoyo (artículos clave, material de clase y guías).