Filogenética & Pangenómica
Inferencia filogenética, pangenómica, MLST, cgMLST y datación molecular. 13 notebooks interactivos con datos reales. Evaluación de certificación disponible. Alineado NTC-ISO 21001.
Grabado en vivo · Retransmisión
Curso impartido en vivo durante la cohorte de Abril 2026. Todas las sesiones fueron grabadas y están disponibles como retransmisión con acceso inmediato. Incluye 13 Jupyter Notebooks, datos reales, código ejecutable y ejercicios.
Temario del curso
13 notebooks que cubren desde alineamiento hasta visualización y datación molecular.
MAFFT — Alineamiento múltiple
Alineamiento de secuencias con MAFFT, parámetros y formatos de salida.
MUSCLE — Alineamiento ensemble
Alineamiento iterativo con MUSCLE y refinamiento de calidad.
trimAl — Recorte de alineamiento
Filtrado y recorte automatizado de posiciones mal alineadas.
IQ-TREE — ML + ModelFinder + UFBoot
Máxima verosimilitud, selección de modelos y bootstrap ultrafast.
RAxML-NG — Máxima verosimilitud
Inferencia filogenética escalable con RAxML-NG.
BEAST2 — Datación filogeografía
Bayesian evolutionary analysis, reloj molecular y datación.
BEAST2 — Divergence Dating
Estimación de tiempos de divergencia con calibraciones.
BEAST2 — MEP tip dating
Datación molecular con fechas de muestreo (tip dating).
BEAST2 — Discrete Phylogeography
Filogeografía discreta con BEAST2.
BEAST2 — BDSKY
Bayesian Skyline poblacional con BDSKY.
Panaroo — Pangenoma
Construcción y análisis de pangenoma bacteriano con Panaroo.
PPanGGOLiN — Pangenoma en grafos
Pangenómica basada en grafos con PPanGGOLiN.
MLST — Sequence typing
Tipificación molecular con MLST clásico.
chewBBACA — cgMLST
cgMLST basado en genes core con chewBBACA.
HGTector — THG
Detección de transferencia horizontal con HGTector.
PastML — Reconstrucción ancestral
Reconstrucción de estados ancestrales con PastML.
Incluye
- 13 Jupyter Notebooks listos para ejecutar en tu máquina o en la nube.
- 5 PDFs de práctica con ejercicios y soluciones (P1–P4 + TC-BIO-07.pdf).
- Datasets reales de genomas bacterianos.
- Acceso a grabaciones de las sesiones del curso (disponible en tu panel al adquirirlo).
- Curso completo comprimido en un solo ZIP (notebooks, PDFs, datos, referencias).
Requisitos
- Conocimientos básicos de Linux y línea de comandos.
- Conceptos generales de biología molecular y genómica.
- Se recomienda tener instalados Conda/Mamba para gestionar entornos.
Modalidad
- Grabado en vivo — retransmisión de la cohorte Abril 2026.
- Acceso inmediato al comprar: notebooks, PDFs, datos y grabaciones.
- Materiales descargables (notebooks, PDFs, datos).
- Soporte técnico vía WhatsApp y correo electrónico.
Certificación
Cohorte Abril 2026 oficialmente concluida. El curso cuenta con tutoría durante 90 días a partir de la fecha de cierre para resolver dudas sobre los módulos o herramientas trabajadas.
Al sentirse preparado, puede solicitar la evaluación de certificación (FOR-EDU-002) mediante videollamada con un analista. La nota mínima de aprobación es ≥ 4.0 / 5.0. Una vez aprobada, se emite un certificado que acredita 26 horas teóricas sincrónicas y 18 horas prácticas sincrónicas — 44 horas en total — de formación especializada en Filogenética Molecular y Pangenómica Bacteriana.