Análisis de Amplicones 16S/ITS DADA2 y mothur
Modalidad Virtual Sincrónica - 4 Días (4 horas/día) - 16 Horas Totales
$160.00
Este curso intensivo de 16 horas (4 días) cubre el pipeline completo de análisis de amplicones 16S rRNA/ITS usando DADA2 y mothur. Aprendás ambos paradigmas: DADA2 para ASVs (variantes exactas) y mothur para OTUs (unidades taxonómicas operacionales).
Contenido destacado:
• Fundamentos de secuenciación de amplicones (16S V1-V9, ITS1/ITS2)
• Control de calidad especializado (FastQC, detección de primers residuales)
• Pipeline DADA2: filtrado, denoising, inferencia de ASVs
• Pipeline mothur: pre-clustering, algoritmo secuencial, OTUs
• Asignación taxonómica (SILVA 138, GTDB, UNITE)
• Análisis de diversidad alfa y beta
• Visualizaciones publication-ready con ggplot2 y phyloseq
Población: Microbiólogos, estudiantes de maestría, bioinformáticos.
Modalidad: Virtual sincrónica (40% teoría, 60% práctica).
Nivel: Intermedio-Avanzado.
Scripts R completos comentados con pipeline reproducible
Datasets de ejemplo (16S V4 microbioma, ITS2 micobioma)
Bases de datos taxonómicas (SILVA 138.1, UNITE 9.0)
Guía de interpretación de resultados
Checklist de buenas prácticas bioinformáticas
Acceso a RStudio Server y plataforma mothur
Certificado digital de participación BioSeryl
Ejecutar pipeline DADA2 completo desde FASTQ hasta tabla de ASVs
Asignar taxonomía y evaluar confianza de clasificaciones
Calcular métricas de diversidad alfa (Shannon, Simpson, Chao1, Faith's PD) apropiadas según pregunta biológica
Realizar análisis estadístico robusto (PERMANOVA, DESeq2, curvas de rarefacción)
Generar figuras publication-ready cumpliendo estándares editoriales
Documentar análisis reproducible con scripts R comentados y bien documentados